跨境电子商务是指不同关境分属的交易主体，所有的交易通过电子商务平台完成，支付方式均为电子支付，商品通过跨境电商物流或者外地仓储送达，这种操作模式称为跨境商业活动。支付业务管理缺陷，目前存在政策缺陷和操作瓶颈。
跨境电商与支付业务管理缺陷
1、政策缺陷
从电商交易形式分析，大部分属于服务贸易范畴，按照国际分类，普遍归入GATS中按服务进行管理。那些电子商务方式完成交易的，需要通过传统运输方式送至客户手里，这样的操作则归货物贸易范畴，属于GATT管理范围。
特殊电子商务种类，服务贸易和货物贸易都不明显，像那些文化、娱乐产品、软件等五行货物，这种交易归属服务贸易或货物贸易均有很大的分歧。我国对《服务贸易外汇管理办法》对这种外汇交易归属管理范畴更难以把握。
支付业务能够突破时空限制，覆盖范围到世界，金融信息和资金链集中在数据平台中。一旦主体缺乏资金或出现违规信用危机、系统故障、经营、信息泄露等异常问题，将会影响客户外汇资金风险。因此，支付业务参与主体和跨境电商进行市场准入规范管理极极其重要。
2、操作瓶颈
电子商务存在一定的虚拟性，会导致外汇监管部门判定其真实性、合法性有一定的困难。通常通过电子支付平台，这部分银行账户不会发生跨境资金流动，而且支付平台资金清算常需要一周到10天，因此，交易主体对外收付款规定较难实施。不同的交易方式对国际申报主体也会有影响。随着跨境电商的发展，国内对外汇备付金仍未有明确规定，同一机构的备付金，能否轧差结算暂无标准，容易使外汇备付金游离在外汇监管体系。
