方瓜和南瓜在外观上、生长习性上有所不同。
在外观上：方瓜是一年生草本瓜果类蔬菜，是五棱形，没有刚刺。花冠裂开片大，是黄色，分雌和雄。果是长圆、扁圆等形，果面有的光滑，有的有瘤，果实在夏末秋初成熟，是红黄、黄褐、红褐、黄白等颜色。南瓜是一年生蔓生草本植物，叶柄比较粗壮，叶片是宽卵形或卵圆形，质稍微柔软，叶脉隆起，卷须有点粗壮，雌雄是同株，果梗有棱和槽，主要因品种而不同，外面有的有数条纵沟有的没有，大多数是长卵形或长圆形。
生长习性上：方瓜的抗病性比较强，适应性也强，凡种植西瓜、甜瓜的地区都可以种植。南瓜是喜温的短日照植物，有较强的耐旱性，对土壤的要求不高，但是肥沃、中性或微酸性沙壤土最好。
