飞机电子发票和行程单的区别只有一个，那就是本质不同。
本质不同：电子发票是发票的一种，也是作为财务报销的凭证，而且电子发票只有服务类别，而行程单是我们手上拿的浅蓝色纸张，上面主要记载了航班时间、航班信息、起终点、出行人个人信息等。
行程单分为电子行程单和纸质行程单，由国家税务总局统一负责管理。后来的电子客票是商务初期市场化的最佳产品，摆脱了传统的物流配送环节，与纸质发票相比，减少了预定的费用，也降低了文件丢失和地址寄送错误的可能性。
电子机票是时代发展的产物，依托现代网络技术，实现机票的买和卖等手续等全流程无纸化、信息化，给旅客带来诸多便利以及为航空公司降低成本。但对于旅客来讲，实际上它的使用与传统纸质机票其实并无差别。
