农村房屋产权证的办理流程：1、向集体经济组织提出申请。2、国土资源管理所进行初审，公布期满无异议后，再报县人民政府审批。3、宅基地批准后，批放宅基地，村民住宅建成后，国土资源部门进行实地检查。4、对符合要求的建房户核发集体土地使用证书，村民凭土地使用证及规划许可证申请办理房屋所有权证。
宅基地允许建房，但建房之前还需要提出申请，经批准以后，才能凭宅基地证和准建证去申请办理房产证。宅基地地上的房屋等建筑物的确权问题，虽然《物权法》已有相关规定，可以办理房产证，但是，由于宅基地本身的使用限制和建筑物无法与土地分割的实施，造成宅基地相对应的房产证没有实际用途：无法像国有土地上的房产一样，可以抵押、出售以获得其实际收益。
宅基地证，即“集体土地使用证”，但集体土地使用证具有更为广泛的定义，既包括宅基地使用权，还包括其他集体或集体内部成员所使用的集体建设用地使用权证明，如：村办学校、办公室、村办企业等等。
集体建设用地使用权是与国有建设用地使用权相对应的，区别在于使用权的权限：集体土地未经批准不得转让、出售，使用权人只能是本集体组织内部成员；而国有建设用地就没有上述相关的规定。
