学费差距：三本学校因为是民办高校，所有的成本支出全部依靠学生学费，学费较高；二本院校由于是省属公办院校，有财政资金的大力支持和投入，学费比三本低。
教学质量：三本院校难以高薪聘请学历高、能力强、教学水平、科研水平拔尖的教育工作者来任教；而二本院校在师资力量方面可以招聘到更好、更优秀的教师。
未来就业：
就业情况来说，二本肯定比三本有优势，这个道理很简单，都知道二本分高一些，而且是公办，三本大部分都是民办，收分低，用人单位都知道这些。
二本和三本毕业后都是本科学历，学历层次是一样的，在考研、考公务员和事业单位方面是一样的效力，当然有些单位招人可能会限制只招一本或二本的学生，但是大多数不会明确限制。
最后建议，如果分数上不了二本的话，上个好的三本学校的好专业也是个不错的选择，有些好的三本学校质量还是可以的。或者作为过渡，努力考个重点大学的研究生也是条路。
