1、外观形态注意观察种子的外观形态，一要判断种子是否健康：种子大小、种皮颜色，种子是否饱满。二是判断种源是否正确：在中药材的种子里有很多相近的形态，需要仔细进行鉴别，最好对比植株进行鉴别。
2、种子活力要确定种子是否具有活力，多种方法：一是剥胚法：优点是很快，缺点是要求技术比较高，而且不适用胚后熟的种子；二是TTC染色发和荧光法：优点也是很快，缺点是要在实验室需要的试剂和器材比较多；三是发芽法：优点准确率高，缺点时间长。
3、种子年份及贮藏方式中药材种子在进行选种时要注意种子的年份，是当年的新种子还是陈种子，贮藏和包装的方式是否真空，种子是否失水，失去油脂等，一些特殊方式处理方式，比如种子是否经过层积处理等。
