1、长期素食会导致微量元素缺乏。人体所需的微量元素例如钙、铁、锌等主要来自肉食。而且素食中草酸含量较多，会阻碍锌、钙和铁等的吸收。
2、长期素食还会导致维生素缺乏。维生素缺乏会导致夜盲症、呼吸道感染、骨质疏松症、溶血性贫血、免疫力低下等。
3、同时还会导致蛋白质摄入不足。长期缺乏蛋白质会造成贫血、消瘦、消化不良、记忆力下降。
4、素食者易患结石。素食中较多的植物纤维会使胆酸吸收率低。素食者体内维生素会缺乏，间接导致胆固醇沉积形成结石。
5、素食对发育期的青少年也有较大的影响，造成性成熟推迟，第二性征发育迟缓。
6、长期的素食还会影响女性的雌激素水平，造成孕育障碍。对于更年期的人更会加重更年期综合症。
