1、 甲状腺囊肿起病时，经常会反复变化，这些和结节有关，其形成机制可能是结节的膨胀性生长，压迫静脉血管，引起循环障碍，因组织缺血发生缩变性，间质内瘀血水肿，液体积聚而成囊肿。
2、 若组织发生缺血性坏死，则会形成坏死性囊肿。周围组织坏死，血管失去组织支持而破裂，则会形成出血性囊肿。如果出现浆液性、出血性和坏死性囊肿，囊壁多为纤维结缔组织，上皮细胞较少。
3、 结节退行性变形成的囊肿可能是整个结节都发生囊变，亦可部分发生囊变，因而形成部分实性、部分囊性的肿块甲状腺癌肿可因坏死、出血、液化而形成囊肿，甲状腺囊肿也可发生癌变。
