1、无论是原设计建造屋顶花园，或是在已建房屋的可上人屋面顶上增建屋顶花园，在建造过程中和建成后的日常使用中，均易破坏屋顶的防水和排水系统，造成屋顶漏水。
2、在女儿墙、天沟和檐口等薄弱环节处出现渗漏。女儿墙（又名：孙女墙）是建筑物屋顶四周围的矮墙，主要作用除维护安疙矬嫣歌全外，亦会在底处施作防水压砖收头，以避免防水层渗水、或是屋顶雨水漫流。天沟指建筑物屋面两胯间的下凹部分。檐口就是指建筑构图中在顶部的典型地带线脚并凸的水平部件。
3、防水层在施工完成后可能会出现裂缝而漏水。产生裂缝的原因很多：气候变化及太阳照射引起的屋面热胀冷缩；屋面板受力后的翘曲变形；地基沉降或墙体承重后坐浆收缩等原因引起的屋面变动；屋面板除变或材料干缩变形等。
