1、hpv患者由于特殊部位的HPV的存在，如在治疗中未能发现或不易被发现的隐蔽处如阴道、宫颈、尿道内、肛肠内等处成为HPv内源性贮藏器，在hpv的复发中起着P分重要的作用。HPV感染的亚型与hpv复发有关，如HPVl6型、1型较HPV6型、11型治疗后容易复发。这与病毒的活性与致病毒力存在着一定关系。
2、治疗不当：患者没有正规治疗或治疗不彻底，表面症状消失了，实际上还是病毒携带者，时间不久，又复发了。少数病人由于性关系长期混乱，导致反复感染。
3、HPV病毒未彻底去除：一般感染HPV主要在表皮，hpv自表皮向外生长，故无论是外用药物还是用激光等治疗，其治疗深度应达到表皮基底细胞层上方，范围应超过疣体边缘1～2毫米，才能将病变组织除净，即便如此，仍有少数hpv复发。
4、hpv的接种感染：在激光或手术时可能将含有HPV的病变组织传染并接种于新的创面上而在治疗后出现新的hpv。
5、被HPV污染的物品是间接传染途径：同样成为反复感的隐患，如患者的内裤、毛巾不经消毒而反复使用，必然将再次污染和接种。
