1、依据企业的性质、以及企业对转让主体的入账科目等的不同，土地增值税的会计处理也是不尽相同的。
2、对于主营房地产业务的企业来说，土地增值税直接计入“税金及附加”科目，会计分录为：
借：税金及附加-土地增值税
贷：应交税费-土地增值税
3、对于兼营房地产业务的企业来说，土地增值税一般计入“其他业务支出”科目，会计分录为：
借：其他业务支出
贷：应交税费-土地增值税
4、如果转让主体已经计入企业的“固定资产”科目，那么转让行为视同固定资产处置行为，转让所发生的土地增值税应该先一并计入“固定资产清理”科目，会计分录为：
借：固定资产清理
贷：应交税费-土地增值税
5、待转让行为结束之后，根据“固定资产清理”科目的余额，计算转让行为所产生的利得或损失，最后转入“资产处置损益”科目。
6、如果转让主体已经计入企业的“无形资产”科目，那么转让所发生的土地增值税应该合并计入无形资产转让分录，最终得出“资产处置损益”，会计分录为：
借：银行存款
累计摊销
无形资产减值准备（如有）
资产处置损益（转让损失）
贷：应交税费-土地增值税
无形资产
资产处置损益（转让利得）
