1、物理清除法拿刷子去刷，市面上卖的磁铁刷，鱼缸刷都很好用，同时换水，效果极佳。缺点是麻烦，角落等地方不易清除，缸子大的话更是大工程。
2、化学清除法使用除藻剂，效果普通，优点是对任何藻类都有效，且可有效清除附着在水草、沉木等不易清除地方的藻类。缺点是依据品质不同对鱼和生态平衡有一定程度的冲击。
3、生物清除法使用除藻动物，如：笠螺，琵琶鼠和藻虾等，来控制藻类的数量，效果极佳，所花费时间较长，但也是最安全也最省力的方式。
4、药物清除法使用罗红霉素片，20厘米的盆放1颗，罗红霉素片杀绿藻见效比较慢，一般要1-2天才出现明显效果。用药有效果几天后换水即可。
